Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd9O35177 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Nedd9O35177 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Nedd9O35177 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Nedd9O35177 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Nedd9O35177 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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Nedd9O35177 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd9O35177 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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