Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d1O08532 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d1O08532 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d1O08532 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms