Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm19965J3QNY8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm19965J3QNY8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Gm19965J3QNY8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm19965J3QNY8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm19965J3QNY8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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