Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc180J3QNE4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc180J3QNE4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ccdc180J3QNE4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms