Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp17lcG5E8I7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp17lcG5E8I7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms