Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip12G5E870 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip12G5E870 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip12G5E870 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms