Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm2564F6Z9S8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm2564F6Z9S8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm2564F6Z9S8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm2564F6Z9S8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2564F6Z9S8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2564F6Z9S8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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