Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8005F6YKY3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm8005F6YKY3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8005F6YKY3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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