Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zfp946F6VWU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp946F6VWU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp946F6VWU8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms