Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8247F6VRJ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm8247F6VRJ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms