Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga10E9Q6R1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga10E9Q6R1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms