Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srsf11E9Q6E5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms