Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r238E9Q373 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r238E9Q373 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms