Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krtap11-1E9Q2E9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms