Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc4E9Q236 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc4E9Q236 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms