Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ2

1810011H11Rik, RIKEN cDNA 1810011H11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810011H11RikE9PVZ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1810011H11RikE9PVZ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1810011H11RikE9PVZ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms