Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clca3bE9PUL3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clca3bE9PUL3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms