Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl3E0CZ16 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms