Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clip3B9EHT4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms