Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU015836B2RUM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms