Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M5A7VMS3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M5A7VMS3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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