Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp2c2A7L9Z8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2c2A7L9Z8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms