Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3173A6NAS3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3173A6NAS3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3173A6NAS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3173A6NAS3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3173A6NAS3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3173A6NAS3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms