Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c4A2ANA3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c4A2ANA3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms