Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FocadA2AKG8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FocadA2AKG8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms