Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms