Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rhbdl2A2AGA4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms