Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms