Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm16A2A935 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm16A2A935 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm16A2A935 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms