Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calcoco2A2A6M5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calcoco2A2A6M5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms