Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trav12-2A0N8N6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trav12-2A0N8N6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trav12-2A0N8N6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms