Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700028J19RikA0A0U1RP08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms