Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4921501E09RikA0A0R4J054 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
4921501E09RikA0A0R4J054 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4921501E09RikA0A0R4J054 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms