Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms