Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms