Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Trbv21A0A0A6YX06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trbv21A0A0A6YX06 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv21A0A0A6YX06 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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