Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm2Q8BGA3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms