Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbtb40Q6PCS8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms