Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms