Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P20040 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P20040 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms