Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lgr5Q9Z1P4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms