Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Col5a3Q9JLI2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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