Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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