Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms