Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gfi1P70338 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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