Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prdm2A2A7B5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms