Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ubqln4Q99NB8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ubqln4Q99NB8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms