Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms