Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms