Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CnbpP53996 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CnbpP53996 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CnbpP53996 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CnbpP53996 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms